La principale légende de Perséphone est l'histoire de son enlèvement par Hadès, son oncle puisqu'il était frère de Zeus.
Hadès tomba amoureux de la jeune fille et l'enleva, pendant qu'elle était en train de cueillir des fleurs, avec des nymphes, dans la plaine d'Enna, en Sicile (c'est, du moins, le lieu le plus généralement admis.
Cet enlèvement se fit avec la complicité de Zeus, et en l’absence de Déméter. C'est à ce moment que ce placent les voyages de Déméter à travers la Grèce pour retrouver sa fille.
A la fin, Zeus ordonna à Hadès de rendre Perséphone à sa mère. Mais cela n'était plus possible. En effet, la jeune fille avait rompu le jeune, alors qu'elle était aux enfers.
Par inadvertance (ou bien tentée par Hadès), elle avait mangé un grain de grenade. Cela suffisait à la lier à tout jamais aux enfers. Comme adoucissement, Zeus décida qu'elle partagerait son temps entre le monde souterrain et le monde d'en-haut. La proportion du partage varie selon les auteurs : tantôt elle reste seulement un tiers de l’année sur la terre, tantôt la moitié.
Perséphone joue un rôle comme épouse d’Hadès dans la légende d’Héraclès, dans celle d'Orphée, dans celle de Thésée et Pirithoos. On disait aussi qu'elle était devenue amoureuse du bel Adonis, qui, à son tour, avait dû partager son temps entre la terre et les Enfers.
Perséphone figure, jointe à Déméter, dans les mystères d’Eleusis. Rome, elle fut identifiée avec Proserpine.